Новая арка, новая история о приключениях и сражения черепашек-ниндзя. Чтобы подчинить себе Землю, Крэнгам для смертельного оружия нужен генетический код активаций. Для этого они уже много тысячелетий скрывались, и находились среди простых людей. Код который им был нужен, по чистой случайности оказался у простой школьницы в Нью-Йорке. Сама же носительница столь ценной информации Клер Флетчер, живя тихо и мирно неожиданно для себя находит новых друзей из канализаций.