Сын Фокса Малдера и Даны Скалли - Уильям, похищен. Они обращаются за помощью к замдиректора Уолтеру Скиннеру. Постепенно выясняется, инициатором похищения возможно стал Курильщик. Тем временем, к Скиннеру приходит Марита Коваррубиас, её дочь Энни исчезла из дома в один день с Уильямом. Уолтер организует небольшую группу в которую так же входят Джон Доггетт и Моника Рейс, агенты отправляются на поиски детей.