История сосредотачивается в пределах двух дней, когда происходит та самая бомбардировка Рэйвенхолма, превратившая шахтёрский городок в жуткий, вымерший край, что населён исключительно зомби всех пород и мастей. Картина разрушения и падения некогда мирного города представлена глазами рабочего по имени Фрэнк - бывшего заключённого тюрьмы "Нова Проспект". Фрэнку удалось сбежать из заточения, и он осел в Рэйвенхолме. Пришедшая в норму жизнь рушится за считанные часы. Город погружается в хаос.

Гордон Фримен - не просто безликий персонаж, но обычный человек, которому просто не повезло оказаться не в том месте. Посреди вспыхнувшего хаоса, что молниеносно охватил "Чёрную Мезу" в момент каскадного резонанса, Фримену придётся испытать свою волю, дабы противостоять собственным страхам и принять, что не всё в мире зависит от личных желаний.

Сопротивление почти достигло Цитадели. Битва в Сити-17 подходит к концу, однако война не собирается заканчиваться. Противник кажется сломленным, однако угроза сохраняется. Это история, известная всем, но раскрытая с точки зрения простого солдата, бойца Сопротивления. Здесь нет откровений и залихватских поворотов сюжета. Это другой Half-Life - глазами обычного человека.