Прошло 10 лет с событий Lost Planet 2.На планете E.D.N III снова мир и покой.Корпорация NEVEC терпит поражение и на смену власти встаёт Джо-бывший солдат NEVEC.Но не успевает новоиспечённый командир начать восстановление планеты,как появляется новая проблема.