На пороге 4186 год. Прошло две тысячи лет, после победы над Жнецами и становления Нового порядка. Галактика Млечный Путь полностью под управлением Галактической Терранской Империи. И теперь Императрица Ника Шепард и её муж поставили задачу: вернуть в родную галактику и возродить старую Империю. И этой задачей решила заняться Миралика Шепард, юная принцесса Империи.

После взрыва Горна, коммандер Шепард попадает в прошлое. Как оказалось, она вернулась на сто семьдесят два года назад. Её поставили на ноги сверх секретная правительственная организация "ЩИТ", которую Шепард некоторое время, после возвращения в строй, сравнивала с Цербером, который воскресил её в первый раз. Но узнав, что на планету надвигается угроза, сравни Жнецам, соглашается работать на щит, так как другого выхода у неё всё равно нет.